Vor dem 2. Weltkrieg gibt es etwa 15 katholische Familien in Markkleeberg. Ostern 1942 wird der erste katholische Gottesdienst gefeiert. Seit 1947 finden Gottesdienste im evangelischen Gemeindesaal in der Mittelstraße statt. 1979 wird der Pfarrsaal der Martin-Luther-Gemeinde in der Pfarrgasse angemietet, zur Kapelle ausgebaut und am 23.12. geweiht. Nach sinkenden Mitgliederzahlen Anfang der 1990er wächst durch viele Zuzüge die Gemeinde ab Mitte des Jahrzehnts. Die Kapelle wird zu klein. Alternativen werden beraten und ein Neubau nach Plänen der Architektin Rita Schmaderer beschlossen. Die Bauarbeiten auf dem Bonhoeffer-Platz beginnen im Juni 2000. Am 31.03.2001 wird die Kirche geweiht und Ostern 2002 läuten die Glocken das erste Mal. Der Baukörper ist einer Schriftrolle nachempfunden, hohe farbige Fenster tauchen den Innenraum in angenehmes Licht. Mit dem 20.01.2019 geht die Pfarrei St. Peter und Paul in der neuen Pfarrei St. Bonifatius Leipzig Süd auf.
